sobota, 26 września, 2020
- Reklama -

Mikrobiologiczne DNA we krwi pacjenta może być znamiennym objawem raka

Kiedy Gregory Poore był studentem pierwszego roku studiów, jego zdrowa babcia była zszokowana, gdy dowiedziała się, że ma późny rak trzustki. Stan zdiagnozowano pod koniec grudnia. Zmarła w styczniu.

   „Nie miała praktycznie żadnych znaków ostrzegawczych” – powiedział Poore. „Nikt nie może powiedzieć, dlaczego jej rak nie został wcześniej wykryty lub dlaczego był odporny na leczenie, które próbowali”.

   Gdy Poore zaczął się uczyć podczas studiów, rak tradycyjnie uważany był za chorobę ludzkiego genomu – mutacje w naszych genach pozwalają komórkom uniknąć śmierci, namnażać się i tworzyć guzy.

źródło: pixabay.com

   Ale kiedy Poore zobaczył badanie Science w 2017 r., które pokazało, jak drobnoustroje atakują większość nowotworów trzustki i są w stanie rozbić główny lek chemioterapeutyczny podawany tym pacjentom, był zaintrygowany pomysłem, że bakterie i wirusy mogą odgrywać większą rolę w chorobie niż ktokolwiek wcześniej rozważał.

   Poore jest obecnie doktorem na Uniwersytecie Kalifornijskim w San Diego School of Medicine, gdzie prowadzi pracę w laboratorium doktora Roba Knighta, profesora i dyrektora Center for Microbiome Innovation.

- Reklama -

   Wraz z interdyscyplinarną grupą współpracowników Poore i Knight opracowali nowatorską metodę identyfikowania, kto ma raka, po prostu analizując wzorce mikrobiologicznego DNA – bakteryjnego i wirusowego – obecnego we krwi.

   Badanie, opublikowane 11 marca 2020 r. w Nature, może zmienić sposób diagnozowania raka.

   „Niemal wszystkie wcześniejsze badania nad rakiem zakładały, że guzy są sterylnymi środowiskami i zignorowały złożoną wzajemną zależność ludzkich komórek rakowych od bakterii, wirusów i innych drobnoustrojów, które żyją w naszym ciele” – powiedział Knight.

   „Liczba genów drobnoustrojów w naszym ciele znacznie przewyższa liczbę genów ludzkich, dlatego nie powinno dziwić, że dają one ważne wskazówki dla naszego zdrowia”.

    Naukowcy po raz pierwszy przyjrzeli się danym mikrobiologicznym dostępnym z The Cancer Genome Atlas, bazy danych National Cancer Institute, zawierającej genomikę i inne informacje z tysięcy guzów pacjentów. Według wiedzy zespołu był to największy wysiłek, jaki kiedykolwiek osiągnięto w celu zidentyfikowania mikrobiologicznego DNA w danych sekwencjonowania ludzi.

   Z 18 116 próbek nowotworów, reprezentujących 10 481 pacjentów z 33 różnymi typami raka, pojawiły się wyraźne sygnatury mikrobiologiczne lub wzorce związane z określonymi typami raka. Zespół zidentyfikował również nieznane wcześniej sygnatury drobnoustrojów, które mocno rozróżniały typy nowotworów. Na przykład obecność gatunków Faecalibacterium odróżniała raka jelita grubego od innych nowotworów.

źró

   Uzbrojeni w profile mikrobiomów tysięcy próbek raka, naukowcy przeszkolili i przetestowali setki modeli uczenia maszynowego, aby powiązać niektóre wzorce mikrobiologiczne z obecnością określonych nowotworów. Modele uczenia maszynowego były w stanie zidentyfikować typ raka pacjenta, wykorzystując jedynie dane mikrobiologiczne z jego krwi.

   Następnie naukowcy usunęli raki wysokiej jakości (stadium III i IV) z zestawu danych i stwierdzili, że wiele rodzajów raka wciąż można było odróżnić na wcześniejszych etapach, opierając się wyłącznie na danych mikrobiologicznych pochodzących z krwi. Wyniki utrzymały się, nawet gdy zespół przeprowadził najbardziej rygorystyczne odkażanie bioinformatyczne na próbkach, co spowodowało usunięcie ponad 90 procent danych mikrobiologicznych.

   Naukowcy sugerują również, że diagnostyka raka może być jedynie początkiem nowo odkrytego mikrobiomu krwi związanego z rakiem.

   „To nowe zrozumienie sposobu, w jaki populacje drobnoustrojów przenoszą się z rakiem, może otworzyć zupełnie nową drogę terapeutyczną”, powiedział Miller-Montgomery. „Wiemy teraz, że istnieją tam drobnoustroje, ale co oni robią? Czy moglibyśmy nimi manipulować lub naśladować je w leczeniu raka?”

ŹródłoGodzinnik.pl

Nissan wspiera brytyjską fabrykę, ale protesty wybuchają w Hiszpanii

Brytyjska fabryka Nissana w Sunderland pozostanie otwarta, ponieważ japoński producent samochodów przeprowadza globalną restrukturyzację podczas pandemii coronavirusa. Producent samochodów...

Polska organizacja pozarządowa gromadzi fundusze na pomoc Etiopii

Polskie Centrum Pomocy Międzynarodowej (PCPM) rozpoczęło zbieranie funduszy na zakup żywności dla etiopskich rodzin borykających się z głodem z powodu ograniczeń COVID-19...

Kiedy mogę znów spotykać się z przyjaciółmi?

Jeżeli zastanawiasz się nad powrotem do normalności i spotykaniem się z ludźmi twarzą w twarz, to musisz wiedzieć, że oficjalne źródła odradzają...

Organizacja charytatywna na rzecz walki z rakiem apeluje o jaśniejsze wytyczne dla walczących z tą chorobą

Wiodąca organizacja charytatywna zajmująca się rakiem w Wielkiej Brytanii wezwała rząd do zapewnienia wyraźniejszych wytycznych dla tych, którzy są chronieni i zostali...

Irrfan Khan: Aktor z Życie Pi zmarł w wieku 53 lat

Irrfan Khan, który wystąpił w takich filmach jak Slumdog Millioner z ulicy, Jurassic World czy Życie Pi zmarł na raka w wieku...

Śmierć doktora, który jako pierwszy dostrzegł koronawirusa

Dr Li Wenliang, jeden z lekarzy, który jako pierwszy wypowiedział się przeciwko próbom chińskiego rządu stłumienia wiadomości o koronawirusie, zmarł z powodu...

Geoinżynieria klimatu, może zmniejszyć ryzyko jego zmian

Geoinżynieria aerozoli stratosferycznych polega na tym, że dodanie warstwy cząstek aerozolu do górnej atmosfery może ograniczyć zmiany klimatu spowodowane przez gazy cieplarniane,...

Poruszanie się po burzy: zawrócić czy poczekać?

„Oczekują, że biznes fuzji i przejęć będzie stopniowo wracał po wybuchu epidemii” - mówi Piotr Kucharczyk, dyrektor ds. Fuzji i przejęć w...

George Floyd. Gwardia Narodowa rozmieszczona w Minneapolis po brutalnych starciach

Gwardia Narodowa USA zostala rozlokowana do Minneapolis po brutalnych starciach po smierci nieuzbrojonego czarnego czlowieka w areszcie policyjnym. George...

Czy słuchanie muzyki pomaga podczas treningu?

Jaki ma wpływ muzyka na efektywność Twoich ćwiczeń? Pomaga czy raczej przeszkadza podczas treningu? Przekonajmy się!

Potężny samolot dostarczy 400 ton sprzętu antywirusowego

Największy na świecie samolot towarowy przywiezie do Polski w przyszłym tygodniu 400 ton sprzętu ochronnego do koronawirusa, podała agencja PAP.

Angielska Premier League będzie wznowiona 17 czerwca meczem Man City przeciwko Arsenal i Aston Villa przeciwko Sheffild Utd

Pełna runda rozgrywek zostanie rozegrana w weekend 19-21 czerwca. Do rozegrania są jeszcze 92 mecze, a pierwsze odbędą się...

Bezdomny otrzymuje metamorfozę, która całkowicie zmienia jego życie

Chociaż słowa „więcej niż na pierwszy rzut oka” powinny być słowami, według których ludzie żyją, często nie mogą powstrzymać się od oceny...

Straż przybrzeżna planuje dodanie dronów do floty powietrznej

Oczekuje się, że w najbliższej przyszłości Drony odegrają rolę w operacjach poszukiwawczo-ratowniczych straży przybrzeżnej (SAR). Agencja Straży Morskiej i...

Czy Polska przejdzie na zieloną energię?

Koła ruchu e-mobilności w Polsce zaczęły się toczyć, ale czy silnik ma wystarczającą moc dzięki dotacjom i inwestycjom, aby wykorzystać ten impet?

Panattoni Europe przejmuje sektor logistyczny w centralnej Polsce

Łódź wraca do swoich korzeni jako dzielnica przemysłowa i umacnia swoją pozycję jako bastion dystrybucji w Europie Środkowo-Wschodniej, budując Central European Logistics...

20 Sposobów jak oszczędzać pieniądze w domu

Jak oszczędzać pieniądze? Oszczędzanie to nie to samo, co odmawianie sobie przyjemności. To nawyk, który pozwala z jednej...

Misja księżycowa – podpisano Europejski kontrakt na wyposażenie misji , której nie było od 52 lat

Europejska Agencja Kosmiczna zwróciła się do firmy lotniczej Airbus o zbudowanie kolejnego modułu serwisowego dla amerykańskiej kapsuły załogowej Orion.

ZOSTAW ODPOWIEDŹ

Please enter your comment!
Please enter your name here